Научное обеспечение на современном этапе определяется Федеральной целевой программой «Развитие водохозяйственного комплекса Рос­сийской Федерации в 2012-2020 годах» в которой определены задачи прикладных научных иссле­дований по водохозяйственному направлению в целях совершенствования государственного управления в области использования и охраны водных объектов, развития научно-технических решений, направленных на обеспечение развития водохозяйственного комплекса, информирования населения о целях и результатах реализации Про­граммы по решению задач улучшения качества окружающей среды и экологических условий жизни человека, просвещения и воспитания на­селения предусматривается следующий перечень мероприятий общесистемного характера:

  • проведение научных исследований и вы­полнение опытно-конструкторских работ, со­ответствующих стратегическим потребностям развития водного хозяйства;
  • формирование единой информационно-а­налитической системы управления водохозяй­ственным комплексом Российской Федерации;
  • осуществление мероприятий по экспер­тно-аналитическому, научно-методическому и информационному сопровождению реализации мероприятий Программы;
  • осуществление мероприятий, направлен­ных на просвещение и информирование насе­ления по вопросам использования и охраны во­дных объектов.

Приказом Минприроды России от 25.06.2012 г. № 163 было утверждено поло­жение об управлении реализацией ФЦП «Раз­витие водохозяйственного комплекса Россий­ской Федерации в 2012-2020 годах». В целях обеспечения согласованности действий госу­дарственных заказчиков при ее реализации госзаказчиком - координатором Программы создан научно-координационный совет Про­граммы. Методическое, информационно-ана­литическое и организационное сопровожде­ние Программы осуществляется дирекцией по ее реализации ФГБУ «Центр развития ВХК».

Приказом Минприроды России от 25.06.2012 г. № 164 было утверждено Поло­жение о НКС ФЦП «Развитие водохозяйствен­ного комплекса Российской Федерации в 2012 - 2020 годах». Достижение цели деятельности НКС осуществляется путем решения следую­щих задач:

  • рассмотрение материалов о ходе реали­зации мероприятий Программы и предостав­ление рекомендаций по их уточнению, а также рассмотрение итогов ее реализации;
  • выявление научных, технических и органи­зационных проблем в ходе реализации Програм­мы и разработка предложений по их решению;
  • рассмотрение предложений по тематике НИОКР, планируемых к выполнению в рамках реализации мероприятий Программы.

Приказом Минприроды России № 222 от 31.08.2012 г. был утвержден план научно-ис­следовательских и опытно-конструкторских работ по реализации ФЦП «Развитие водохо­зяйственного комплекса Российской Федера­ции в 2012-2020 годах» на 2012-2014 годы». Планом предусматривается разработка базо­вых проектов по 11 направлениям научных ис­следований:

  1. Научные исследования, направленные на изучение проблем формирования и оценки во­дных ресурсов.
  2. Научные исследования в области право­вого обеспечения и государственного управле­ния.
  3. Научные исследования в области эконо­мики водопользования.
  4. Научные исследования интегрированного управления использованием и охраной водных объектов.
  5. Научные исследования проблем качества вод.
  6. Научные исследования в области предот­вращения негативного воздействия вод.
  7. Научно-аналитическое обоснование со­вершенствования функционирования водного реестра.
  8. Научные исследования в области совер­шенствования государственного мониторинга водных объектов.
  9. Научные исследования, направленные на решение региональных водохозяйственных проблем.
  10. Научные исследования по разработке нормативов допустимого воздействия на во­дные объекты.
  11. Научные исследования по разработ­ке правил использования водохранилищ ком­плексного назначения.

По данным ФГБУ «Информационно-анали­тический центр развития водохозяйственного комплекса (ФГУ «Центр развития ВХК») Мин­природы России в 2013 г. В рамках НИОКР, вы­полняемых по ФЦП «Развитие водохозяйствен­ного комплекса РФ в 2012-2020 годах» были завершены госконтракты по следующим темам:

  1. «Изучение путей поступления и мигра­ции лекарственных средств в системы водо­снабжения» (ИВП РАН);
  2. «Разработать перечень требований к вы­бору моделей переноса загрязняющих веществ в естественных водных объектах» (ИВП РАН);
  3. «Изучение и оценка роли дефицита кисло­рода и вызываемых им изменений в видимом со­ставе водной биоты при эвтрофировании источ­ников водоснабжения» (ФГУП «АзНИИРХ»);
  4. «Провести ретроспективный анализ со­стояния водных объектов в различных широт­ных зонах» (ФГБУ «ГХИ»);
  5. «Выполнить аналитическое исследова­ние по совершенствованию правового регули­рования в сфере водных отношений Российской Федерации» (МГУ имени М.В. Ломоносова);
  6. «Совершенствование мониторинга со­стояния эко-системы и качества вод Ладожского озера и р. Невы» (ИНОЗ РАН).